工程预算审计主要针对工程项目决算的，在一个建设项目竣工完成，建设单位与施工单位结算工程款时进行的。工程预算审计就是工程预算审核（审价），是工程预算咨询单位咨询业务的一部分。受业主委托对其工程项目的概算、预算及结算等，依据现行 政策法规、计价依据及相关工程技术资料对送审造价的工程量、单价及取费等进行逐项审核。在运用工程量清单计价模式进行工程预算审计工作时，可以从以下几个方面来进行：
工程预算它是指审计人员亲临建筑物现场，对审计项目进行实地测量和观察，从而准确地审计已完工程建设项目的实际投资情况，发现疑点，验证事实，核实实际工程量，审定工程预算的一种方法。例如：某工程决算审计时审计人员经现场实际测量和观察，现场测的围墙工程量比实际工程量少68.6m；砼地坪工程量少120m2；以上两项核减工程预算12.36万元。它是指审计人员通过调查询问被审计单位参与基建项目管理的知情者，通过知情人事收集整理审计信息，以证实基建工程量与工程价款的真实性、合理性的一种方法。如审计人员某年对某单位一建筑基建工程决算进行审计，通过建设单位了解到该项目地板砖为甲供材，
施工单位施工过程中对技术资料的未能完整归档或有意不建档，造成建设单位在工程竣工后无法建立完整的工程资料档案并按要求报送工程结算所需资料，从而使审计工作周期拉长、风险加大。这个问题也的确存在。不过，按照一般的情况，审计周期是按提供完整的资料开始计算的。除非你自己的要求没有到位，那也怨不得别人。什么叫风险加大？是你审计费用不够用了吧？既然做了审计这个行业，就要有这个思想准备，否则人家建设单位为什么出钱给你啊！建设单位缺乏工程技术专管人员和工程技术专业知识或工程技术人员职业道德水准不高，造成工程项目施工中不合规的变更签证增多，从而使得工程预算随意增大。
工程预算的作用：
1.工程预算是施工企业与建设单位结清工程费用的依据；
2.工程预算是施工企业考核工程成本，进行经济核算的依据；
3.工程预算是编制概算定额和概算指标的依据。
工程预算的进行一般分为6个步骤：
1、熟悉招标相关文件与图纸
2、查询材料报价
3、确定劳务价格
4、工程量计算
5、组好综合单价
造价偏差管理（1）偏差预测：对项目进行中可能出现的偏差因素进行预测与分析。（2）检查与计算：对项目一定进度条件下的造价进行计算与检查，得出检查当时条件下的造价。（3）对比：对项目已完工程的预算造价与实际造价进行对比，发现造价偏差，计算出偏差值。（4）分析：对比较的结果进行分析，确定偏差幅度并找出偏差产生的原因。（5）纠偏：根据项目的具体情况和偏差分析结果，建议或采取适当的措施，使造价偏差控制在允许的范围以内或进行项目总造价目标的调整。