工程预算由于间接费、利润、税金等各项费用，是按照工程的专业（土建、安装、装饰、市政、人防、园林等）和工程类别（即按照施工难易程度分一、二、三、四类）分别规定了取费标准，审查时应该注意以下几个问题：审查取费标准是否与所用定额相匹配。在编制决算时，主体工程选用某专业定额，则取费标准必须选用与该专业配套使用的标准审查取费标准是否与工程类别相吻合。首先，根据工程规模及工程类别划分标准表，确定工程类别；然后，审查是否按确定的工程类别计取费用。如土建工程与安装工程的工程类别应分别按各自的工程类别划分标准表确定。
工程预算它是指审计人员在审计过各中会同被审计单位有关人员与施工单位有关人员及现场监理人员到建筑现场，对有疑点的隐蔽工程进行挖开核实工程做法与工程量、价款的方法。抽样测定法较为直接，容易验证出问题的真假，但是审计风险较大，所以一般在确有问题时方可实行抽样定点的方式。例如：某年审计某项工程时，审计人员通过了解得知，该项目管道回填施工时未按设计要求进行筛土回填，且未做警示标志。经现场抽样开挖发现有两个标段的部分施工班组未按设计要求施工。
工程量清单计量一般是根据每月完成的合同内实物工作量经监理工程师签认合格准予计量的工程细目，它有阶段性、按实计量的特点。根据这个特点，应在过程中来进行控制，而不是依靠事后发现超计量以后再扣回。工程预算计量人员（工地监理组、指挥部或总监办的工程部、计划部）均应认真学习合同文件和招标文件中的计量条款，心中应明确哪些项目可以计量，哪些项目不能计量，属于包含在其他工程项目中的内容（例如：涵洞计量是以延米综合单价计量的，因此其挖基、回填、清淤、基础垫层、出入口铺砌等均不能单独计量。
工程设计人员和预算人员缺乏相互配合，也是造成预算控制出现问题的重要原因。有的预算人员认为，设计方案是专业设计人员的事情，他们希望设计人员在完成全部设计后，提供终设计图纸或工程量，自己只需按照定额、编制规定等进行概预算编制，不管设计技术和经济严重脱节，难于从根本上有效控制工程预算。而有的设计人员则缺乏经济意识，他们认为，只要按照业主委托书的要求进行设计，出图就可以了，至于工程预算，那是预算人员的事，对如何降低工程预算看成与已无关的事。预算人员与设计人员各做各的事，缺乏必要的协调配合，这种现象目前比较普遍，较大地影响了预算控制的有效进行。在工程设计中，设计和预算人员双方要紧密配合，加强沟通协调，互相不断反馈信息。预算员首先要弄清设计意图，对于不清楚的地方，要积极咨询，设计人员则需要给予积极配合。同时，宁德工程预算设计人员进行方案比选时，应当及时给预算人员提供设计条件。当阶段性的预算对比完成后，预算人员应及时向设计人员反馈信息，使设计人员心中有数，及时作出对设计方案的改进或完善。只有这样，双方精诚合作，密切配合，才能在满足工程功能要求的同时， 限度地降低工程预算。