近年来，随着政府基本建设力度的加大，投资审计倍受社会各界关注，各级政府部门对投资高重视，这对审计和审计人员来说，既是一种鼓励，也是一种鞭策和压力然而，政府投资项目审计任务繁重与审计力量不足之间的矛盾 ，一直是困扰政府投资项目审计事业发展的重大问题。（某经济特区政府投资项目审计监督条例》第三十条规定“审计进行项目工程预算审计，应当自被审计单位交齐本条例第二十八条规定的资料之日起四十五日内出具审计结论性文书。当前，政府投资项目结算中的高估冒算还比较普遍， “三超”现象严重 ，通过重点抽查审计，可以发现并纠正大量违法乱纪行为，从总体上有效遏制超计划投资，节约大量的政府财政资金。这种方法的优点是审计时间短、风险小、效果好，适合对标底、专项预算和工程量清单的审计。
工程预算在我国工程预算控制中的应用问题及建议：
（1）建设单位及施工单位不了解和不重视
我国以公有制为主体，多种所有制经济共同发展的基本经济制度决定了我国许多大中型建设项目的建设单位都是 ，且大多数建设单位对工程预算控制的重视远远不够，不少建设单位是想方设法把资金用完，而不是节约资金。施工单位则只注重承接业务，不注重对业主的承诺实现。
（2）价值工程的实施未贯穿于工程项目全生命周期
目前，我国大多数工程项目应用价值工程的造价控制都仅局限于某一阶段，如项目竣工结算阶段、设计阶段、材料采购阶段等，而没有认识到价值工程应该贯穿于整个项目的全生命周期。
工程预算编制的流程：
1.预算部经办人根据招标谈判约定条件，结合公司前期合同样本起草合同草案（技术质量及工期指标由工程部提供），该草案内容是经施工单位认可的内容。
2.将合同草案交律师审阅。
3.施工单位工程预算签字盖章后的合同，签交与律师审核见证。
4.合同经办人、工程预算主管、总经理助理签字认可。
5.甲方总经理签字，并盖合同专用章。
6.合同一式八份，甲方留六份，返乙方单位两份。
工程预算它是指审计人员在审计过各中会同被审计单位有关人员与施工单位有关人员及现场监理人员到建筑现场，对有疑点的隐蔽工程进行挖开核实工程做法与工程量、价款的方法。抽样测定法较为直接，容易验证出问题的真假，但是审计风险较大，所以一般在确有问题时方可实行抽样定点的方式。例如：某年审计某项工程时，审计人员通过了解得知，该项目管道回填施工时未按设计要求进行筛土回填，且未做警示标志。经现场抽样开挖发现有两个标段的部分施工班组未按设计要求施工，由于该项工程设计要求所规定的都是对周围环境破坏极其重要的标志。因此，审计要求施工单位对此部分的工程进返工后按时计取工程造价，由此造成的损失由施工单位、监理单位共同承担，并对建设单位管理不利做了相应的处罚。